Im Anschluss war er mehrere Jahre als Consultant bei der skandinavischen Unternehmensberatung Jaakko Pöyry tätig, die heute unter dem Namen AFRY firmiert. Danach promovierte der Jubilar bei Univ.-Prof. Walter Warkotsch an der Technischen Universität München im Bereich der Rundholzlogistik.
Bis Ende 2023 war Bauer fast 18 Jahre lang Geschäftsführer des Bayerischen Holzclusters mit proHolz Bayern. Mit seinem Team hat er durch zahlreiche Ausstellungen, Messeauftritte und Fachveranstaltungen entscheidend zur Förderung der Holzbaukultur in Bayern beigetragen.
Darüber hinaus engagiert sich der Netzwerker unter anderem im Messebeirat der Interforst in München, im Vorstand des Fördervereins der Hochschule Rosenheim sowie als Juror beim Start-up-Wettbewerb für nachwachsende Rohstoffe Plan-B.